Als wichtigster Verkehrsknotenpunkt des Landes Salzburg ist der Salzburger Hauptbahnhof mit bis zu 25.000 Fahrgästen täglich einer der größten Bahnhöfe Österreichs.
Der künftige Durchgangsbahnhof wird als regionale und internationale Drehscheibe den Anforderungen eines modernen Bahnzeitalters voll gerecht werden. Hoher Kundenkomfort, kurze Wege, barrierefreies Umsteigen, optimale Fahrgastinformation, eine zentrale Passage mit Einkaufsmöglichkeiten und ein einzigartiges architektonisches Konzept mit der Integration von denkmalgeschützten, historischen Bauteilen in modernste Bahninfrastruktur werden der Festspielstadt ein unverwechselbares neues Entree geben.

In Abstimmung mit dem Bundesdenkmalamt entsteht hier bis 2014 einer der modernsten Bahnhöfe Österreichs, wobei die historische Dachkonstruktion über dem heutigen Mittelbahnsteig erhalten bleibt. Die Personentunnel werden durch eine breite Passage abgelöst, die die beiden Stadtteile Schallmoos und Elisabeth-Vorstadt miteinander verbinden wird. Dadurch wird eine komfortable Erschließung der Bahnsteige ermöglicht. Gemeinsam mit der Errichtung der Gleisanlagen werden die Eisenbahnbrücken über die Plainstraße, die Rainerstraße und das Nelböckviadukt erneuert.

Der Umbau findet unter laufendem Betrieb des Bahnverkehrs statt. Während der verschiedenen Bauphasen kommt es zu vorübergehenden Sperren einzelner Bahnsteige. Die betroffenen Züge fahren dann jeweils andere Bahnsteige an.
Hohe Anforderungen werden auch an die Logistik gestellt, da die Bauarbeiten im innerstädtischen Raum auf sehr beengten Platzverhältnissen durchgeführt werden müssen.

Der Salzburger Hauptbahnhof hatte lange Zeit die Funktion eines Grenzbahnhofes in Richtung Deutschland und wurde daher als kombinierter Durchgangs- und Inselbahnhof angelegt. Bisher endete ein Großteil der Züge am Salzburger Hauptbahnhof. Mit dem neuen Durchgangsbahnhof können künftig mehr Züge durchgeführt werden. Durch diesen Ausbau der Schieneninfrastruktur wird die West-Ost-Verbindung verbessert und der Hauptbahnhof Salzburg noch effizienter in das transeuropäische Netz von Paris und Stuttgart über Wien nach Bratislava (TEN 17) integriert.